Пониженный тариф взносов МСП 2026: настройка в 1С:ЗУП

Коротко: С 2026 года малый и средний бизнес применяет пониженный тариф страховых взносов 15% к выплатам сверх 1,5 МРОТ. При этом МРОТ вырос до 27 093 рублей, что меняет базу расчёта. В 1С:ЗУП 3.1 необходимо проверить учётную политику, вид тарифа и настройки организации — иначе программа посчитает взносы по общей ставке 30%, что приведёт к переплате и ошибкам в отчётности.

Почему расчёт взносов для МСП снова изменился в 2026 году?

Льготный режим страховых взносов для субъектов малого и среднего предпринимательства (МСП) действует с апреля 2020 года. Однако каждый год механизм расчёта претерпевает уточнения: меняется МРОТ, корректируются предельные базы, вносятся поправки в Налоговый кодекс. 2026 год не стал исключением — совокупность изменений затронула сразу несколько ключевых параметров.

Главные новшества 2026 года для МСП:

МРОТ с 1 января 2026 года — 27 093 рубля (федеральный). Именно этот показатель является основой для «точки раздела» между обычным и пониженным тарифом.
Предельная база для исчисления взносов в 2026 году — 2 979 000 рублей (ориентировочно, окончательное значение устанавливается постановлением Правительства РФ).
Единая предельная база (ЕПБ) сохраняется: взносы рассчитываются от единой базы по единому тарифу.
Ставка для МСП к части выплат сверх 1,5 МРОТ остаётся 15% (единый пониженный тариф), однако с учётом нового МРОТ абсолютная сумма «льготной» части меняется.
Расширение реестра МСП: с 2026 года упрощены критерии включения в реестр для ряда отраслей, что позволяет большему числу компаний применять льготу.

Бухгалтеры, которые ведут задачи по 1С:ЗУП, должны убедиться, что все эти изменения корректно отражены в настройках программы до начала расчёта зарплаты за январь 2026 года.

Как работает механизм пониженного тарифа МСП в 2026 году?

Логика расчёта взносов для МСП двухступенчатая. Каждый месяц выплаты каждому сотруднику делятся на две части:

Часть в пределах 1,5 МРОТ — облагается по единому тарифу: 30% до достижения предельной базы и 15,1% после её превышения.
Часть сверх 1,5 МРОТ — облагается по единому пониженному тарифу 15%.

Важный нюанс: МРОТ берётся федеральный, а не региональный. Даже если в субъекте РФ установлен более высокий МРОТ, для целей расчёта взносов МСП используется именно федеральный показатель — 27 093 рубля в 2026 году. Порог раздела составляет 1,5 МРОТ = 40 639,50 рубля.

Пример расчёта взносов для сотрудника МСП в 2026 году

Допустим, сотрудник получает оклад 60 000 рублей. Предельная база не превышена.

Параметр	Ставка	Сумма взносов
До 1,5 МРОТ (40 639,50 руб.)	30%	12 191,85 руб.
Сверх 1,5 МРОТ (19 360,50 руб.)	15%	2 904,08 руб.
Итого		15 095,93 руб.

Суммарные взносы: 12 191,85 + 2 904,08 = 15 095,93 рубля (около 25,2% от фонда оплаты труда). Без льготы МСП взносы составили бы 60 000 × 30% = 18 000 рублей. Экономия — около 2 904 рублей в месяц на одного сотрудника.

Кто имеет право на пониженный тариф МСП в 2026 году?

Право на применение льготного тарифа имеют организации и ИП, которые одновременно соответствуют следующим условиям:

Включены в Единый реестр субъектов МСП (реестр ведёт ФНС, обновляется 10-го числа каждого месяца).
Относятся к категории микропредприятия, малого или среднего предприятия по критериям Федерального закона № 209-ФЗ.
Не ведут деятельность в запрещённых для льготы отраслях (финансовые организации, подакцизные производства и ряд других).

С 2026 года критерии численности для МСП остаются прежними: микропредприятие — до 15 человек, малое — до 100, среднее — до 250. Однако порог выручки для среднего предприятия увеличен до 4 миллиардов рублей. Это означает, что ряд компаний, ранее не входивших в реестр, теперь может воспользоваться льготой.

Важно: если организация исключена из реестра МСП (например, из-за несдачи отчётности), право на льготный тариф утрачивается с месяца исключения. В 1С:ЗУП необходимо оперативно менять вид тарифа, иначе взносы будут занижены.

Пошаговая настройка страховых взносов МСП в 1С:ЗУП 3.1

Рассмотрим полный алгоритм настройки 1С:Зарплата и управление персоналом 3.1 для корректного расчёта взносов по тарифу МСП с 2026 года.

Шаг 1. Проверка и установка вида тарифа страховых взносов

Перейдите в меню «Настройка» → «Организации», выберите нужную организацию и откройте вкладку «Учётная политика и другие настройки». Нажмите ссылку «Учётная политика».

В форме учётной политики найдите раздел «Страховые взносы». В поле «Вид тарифа» должно быть установлено значение:

«Для субъектов малого и среднего предпринимательства»

Если это значение не установлено или стоит другой тариф — исправьте. Обязательно укажите дату начала применения тарифа — 01.01.2026 (или более раннюю, если льгота применялась ранее).

Шаг 2. Проверка актуальности МРОТ в программе

После установки обновлений платформы и конфигурации МРОТ должен обновиться автоматически. Проверить текущее значение можно через меню «Настройка» → «Производственный календарь» или в разделе «Зарплата» → «Сервис» → «Минимальный размер оплаты труда».

Убедитесь, что с 01.01.2026 в программе установлен МРОТ = 27 093 рубля. Если обновление не применено — внесите значение вручную через форму редактирования МРОТ.

Шаг 3. Обновление предельных баз страховых взносов

Предельные базы вносятся автоматически при обновлении конфигурации. Проверить их можно через «Настройка» → «Параметры учёта» → «Настройка состава начислений и удержаний» → вкладка «Страховые взносы».

Для 2026 года предельная единая база должна составлять около 2 979 000 рублей. При необходимости скорректируйте вручную, однако рекомендуется дождаться официального обновления конфигурации — ручные правки могут быть перезаписаны.

Шаг 4. Проверка настроек начислений

Перейдите в «Настройка» → «Начисления» и убедитесь, что для всех видов начислений (оклад, премии, надбавки) корректно настроен вид дохода для целей страховых взносов. Начисления, которые не облагаются взносами (материальная помощь до 4 000 руб., суточные в пределах норм и т.д.), должны иметь соответствующий код дохода.

Программный контроль расчёта взносов МСП в 1С:ЗУП

Для автоматической проверки корректности применения тарифа МСП можно использовать обработку на встроенном языке 1С. Следующий пример демонстрирует запрос, который позволяет выявить сотрудников, у которых взносы рассчитаны не по тарифу МСП за указанный период:

// Функция проверки применения тарифа МСП по начислениям
// Возвращает таблицу значений с сотрудниками и суммами взносов
Функция ПроверитьТарифМСП(Организация, НачалоПериода, КонецПериода) Экспорт

	// Формируем запрос к регистру расчёта страховых взносов
	Запрос = Новый Запрос;
	Запрос.Текст =
		"ВЫБРАТЬ
		|	Взносы.ФизическоеЛицо КАК Сотрудник,
		|	Взносы.Регистратор КАК Документ,
		|	Взносы.ВидВзноса КАК ВидВзноса,
		|	Взносы.БазаВзносов КАК База,
		|	Взносы.СуммаВзноса КАК Сумма,
		|	Взносы.ТарифВзносов КАК Тариф
		|ИЗ
		|	РегистрРасчёта.НачислениеСтраховыхВзносов КАК Взносы
		|ГДЕ
		|	Взносы.Организация = &Организация
		|	И Взносы.ПериодРегистрации >= &НачалоПериода
		|	И Взносы.ПериодРегистрации <= &КонецПериода
		|	И Взносы.ТарифВзносов <> ЗНАЧЕНИЕ(Перечисление.ТарифыСтраховыхВзносов.МалыйСреднийБизнес)
		|УПОРЯДОЧИТЬ ПО
		|	Взносы.ФизическоеЛицо";

	Запрос.УстановитьПараметр("Организация", Организация);
	Запрос.УстановитьПараметр("НачалоПериода", НачалоПериода);
	Запрос.УстановитьПараметр("КонецПериода", КонецПериода);

	// Выполняем запрос и получаем результат
	РезультатЗапроса = Запрос.Выполнить();

	Если РезультатЗапроса.Пустой() Тогда
		// Все начисления по тарифу МСП — ошибок нет
		Возврат Новый ТаблицаЗначений;
	КонецЕсли;

	// Возвращаем выборку для анализа
	Выборка = РезультатЗапроса.Выгрузить();
	Возврат Выборка;

КонецФункции

// Пример вызова функции для анализа января 2026 года
Процедура ПроверитьВзносыЗаЯнварь2026()

	Организация = Справочники.Организации.НайтиПоНаименованию("ООО Ромашка");
	НачалоПериода = Дата(2026, 1, 1);
	КонецПериода = КонецМесяца(НачалоПериода);

	ТаблицаОшибок = ПроверитьТарифМСП(Организация, НачалоПериода, КонецПериода);

	Если ТаблицаОшибок.Количество() > 0 Тогда
		// Выводим предупреждение о некорректном тарифе
		Предупреждение(
			"Обнаружены начисления не по тарифу МСП: "
			+ ТаблицаОшибок.Количество() + " записей."
			+ Символы.ПС + "Проверьте настройки учётной политики."
		);
	Иначе
		// Всё в порядке
		Сообщить("Тариф МСП применяется корректно для всех сотрудников.");
	КонецЕсли;

КонецПроцедуры

Следующий код демонстрирует расчёт суммы взносов МСП вручную для контрольной проверки — можно использовать в обработке для сверки с данными программы:

// Функция расчёта страховых взносов МСП для одного сотрудника за месяц
// Параметры:
//   СуммаНачисления - начисленная зарплата за месяц
//   НакопленнаяБаза - база с начала года (для контроля предельной базы)
//   МРОТ            - федеральный МРОТ на текущий год
//   ПредельнаяБаза  - единая предельная база взносов на текущий год
Функция РассчитатьВзносыМСП(
		СуммаНачисления,
		НакопленнаяБаза,
		МРОТ = 27093,
		ПредельнаяБаза = 2979000) Экспорт

	// Структура для хранения результата
	Результат = Новый Структура;
	Результат.Вставить("ВзносВПределах", 0);
	Результат.Вставить("ВзносСверх", 0);
	Результат.Вставить("Итого", 0);

	// Точка раздела — 1,5 МРОТ
	ПорогРаздела = 1.5 * МРОТ;

	// Часть выплаты в пределах 1,5 МРОТ — единый тариф
	ЧастьВПределах = Мин(СуммаНачисления, ПорогРаздела);

	// Часть выплаты сверх 1,5 МРОТ — единый пониженный тариф МСП 15%
	ЧастьСверх = Макс(СуммаНачисления - ПорогРаздела, 0);

	// Ставка для части, попадающей на единый тариф:
	// 30% до предельной базы, 15,1% после её превышения
	Если НакопленнаяБаза >= ПредельнаяБаза Тогда
		СтавкаВПределах = 0.151;
	Иначе
		СтавкаВПределах = 0.30;
	КонецЕсли;

	// Расчёт взносов по двум частям
	Результат.ВзносВПределах = ЧастьВПределах * СтавкаВПределах;
	Результат.ВзносСверх = ЧастьСверх * 0.15;

	// Суммируем взносы
	Результат.Итого = Результат.ВзносВПределах + Результат.ВзносСверх;

	Возврат Результат;

КонецФункции

// Пример использования функции расчёта
Процедура ТестРасчётаВзносовМСП()

	СуммаЗарплаты = 60000; // Оклад сотрудника
	НакопленоСНачалаГода = 120000; // База с января по предыдущий месяц

	Взносы = РассчитатьВзносыМСП(СуммаЗарплаты, НакопленоСНачалаГода);

	// Выводим результат расчёта
	Сообщить("Взнос с части в пределах 1,5 МРОТ: " + Взносы.ВзносВПределах);
	Сообщить("Взнос с части сверх 1,5 МРОТ: " + Взносы.ВзносСверх);
	Сообщить("Итого взносов: " + Взносы.Итого);

КонецПроцедуры

Типичные ошибки при настройке взносов МСП в 1С:ЗУП и как их исправить

Практика работы со специалистами, которые публикуют задачи на найти разработчика 1С, показывает: большинство проблем с расчётом взносов МСП возникает из-за типовых ошибок конфигурирования.

Ошибка 1. Тариф МСП не установлен в учётной политике

Симптом: программа рассчитывает взносы по общей ставке 30% со всей суммы начисления. Решение: зайти в учётную политику организации, установить вид тарифа «Для субъектов МСП» с даты включения в реестр.

Ошибка 2. Устаревший МРОТ в базе данных

Симптом: деление на части «в пределах 1,5 МРОТ» и «сверх 1,5 МРОТ» происходит по старому значению (например, 19 242 рублей — МРОТ 2024 года). Решение: проверить значение МРОТ в настройках программы и обновить до 27 093 рублей с 01.01.2026.

Ошибка 3. Неверная предельная база взносов

Симптом: после превышения предельной базы программа не переключается на пониженную ставку (15,1% вместо 30%). Решение: обновить конфигурацию до актуальной версии или вручную скорректировать предельную базу в параметрах учёта.

Ошибка 4. Применение тарифа МСП к выплатам, которые не облагаются льготой

Некоторые виды выплат (например, доходы от участия в уставном капитале, ряд компенсаций) не входят в базу для льготного тарифа. Убедитесь, что для таких начислений в настройках указан корректный вид дохода.

Ошибка 5. Отсутствие пересчёта при изменении тарифа в середине года

Если организация была включена в реестр МСП не с начала года, необходимо пересчитать взносы за месяцы, когда льгота уже действовала. В 1С:ЗУП для этого используется документ «Перерасчёт страховых взносов».

Найдите специалиста для решения этой задачи на koderion.ru

Читайте также: услуги по 1С:ЗУП

Где в 1С ЗУП настроить страховые взносы для МСП: точный путь в меню

Если ищете, где в 1С ЗУП настроить страховые взносы для МСП — вся настройка сосредоточена в карточке организации, а не в общих параметрах учёта. Многие новички тратят время, перебирая разделы меню. Держите точный маршрут.

Откройте раздел «Настройка» в левом меню (в редакции 3.1 — иконка шестерёнки внизу панели разделов).
Выберите пункт «Организации». Если организация одна и настроен упрощённый интерфейс — путь короче: «Настройка» → «Реквизиты организации».
В карточке организации перейдите на вкладку «Учётная политика и другие настройки».
Нажмите гиперссылку «Учётная политика».
В открывшейся форме найдите поле «Вид тарифа» — здесь и выбирается «Для субъектов малого и среднего предпринимательства».

Ключевой момент: у поля «Вид тарифа» есть история изменений. Нажмите на значок истории (стрелка рядом с полем) и задайте запись с датой 01.01.2026. Если просто перезаписать текущее значение без указания даты, ЗУП может применить тариф задним числом или, наоборот, не подхватить его в январском расчёте.

Как проверить, что тариф применился в расчётной ведомости

Настройку недостаточно сохранить — надо убедиться, что она работает. После расчёта зарплаты за январь 2026 откройте документ «Начисление зарплаты и взносов» и перейдите на вкладку «Взносы». У каждого сотрудника взносы должны быть разбиты на две строки: часть в пределах 1,5 МРОТ (ставка 30%) и часть сверх (15%). Если строка одна и вся сумма умножена на 30% — тариф не подхватился, вернитесь к истории поля «Вид тарифа» и проверьте дату.

Быстрый контроль по одному человеку: возьмите оклад 60 000 руб., взносы должны выйти около 15 096 руб., а не 18 000 руб. Расхождение сразу показывает, что программа считает по общей ставке.

Что делать, если организацию исключили из реестра МСП в середине года?

ФНС обновляет реестр МСП 10-го числа каждого месяца. Если компанию исключили — например, за несданную отчётность или превышение лимитов, — право на пониженный тариф теряется с месяца исключения. В ЗУП это отражают так:

Откройте учётную политику организации и в истории поля «Вид тарифа» добавьте новую запись с датой начала месяца исключения. Установите вид тарифа «Организации, не относящиеся к льготным категориям» (общий тариф 30%).
Если зарплата за этот месяц уже начислена по льготному тарифу — пересчитайте её. Заново откройте документ «Начисление зарплаты и взносов» и нажмите пересчёт, либо создайте документ «Перерасчёт страховых взносов» (раздел «Налоги и взносы»).
Проверьте, что доначисленная разница попала в отчётность за нужный период.

Обратная ситуация — компанию включили в реестр в марте. Тогда с января по февраль взносы считались по 30%, а с марта нужно применить льготу. Задним числом за январь-февраль пересчитывать не нужно: льгота действует только с месяца попадания в реестр. Просто добавьте запись в историю тарифа с датой 01.03 и продолжайте расчёт.

Совет: заведите себе привычку 11-12 числа каждого месяца сверять статус организации в реестре МСП. Один пропущенный месяц исключения — и налоговая доначислит взносы плюс пени, а исправлять придётся уже через уточнённые расчёты.

Как сверить взносы МСП с отчётностью: РСВ и персонифицированные сведения

Настройка тарифа — половина дела. Вторая половина всплывает в конце квартала, когда РСВ не сходится с расчётными листками. Проверять надо до отправки, а не после требования из налоговой.

Шаг 1. Отчёт по взносам внутри ЗУП

Раздел «Налоги и взносы» → «Отчёты по налогам и взносам». Нужны два отчёта:

«Анализ взносов в фонды» — показывает базу и сумму по каждому сотруднику. Сгруппируйте по месяцам и разверните любого человека с окладом выше 40 639,50 руб. Должны быть видны две базы: до порога и сверх него.
«Проверка расчёта взносов» — сравнивает то, что программа рассчитала, с тем, что она должна была рассчитать по текущим настройкам. Пустой результат — хорошо. Строки с расхождением — сигнал, что документы проводились до правки учётной политики.

Шаг 2. Проверка РСВ

Откройте «Отчётность, справки» → «1С-Отчётность» и сформируйте РСВ за отчётный период. В подразделе с расчётом взносов по каждому коду тарифа плательщика для МСП формируется отдельный блок: часть базы в пределах 1,5 МРОТ и часть сверх. Если блок один и вся база сидит в общем тарифе — программа считала по 30% на всю сумму, тариф в учётной политике не подхватился.

Дальше — арифметика на две минуты. Возьмите итоговую базу из РСВ и сравните с суммой начислений из отчёта «Анализ взносов в фонды» за тот же квартал. Расхождение в копейках — округление, нормально. Расхождение в тысячах — ищите непроведённый документ или начисление с неверным видом дохода.

Шаг 3. Персонифицированные сведения

Сведения по физлицам сдаются помесячно. Суммы выплат в них должны совпадать с базой из РСВ за соответствующий месяц. В ЗУП это делает автозаполнение, но если после сдачи вы пересчитывали взносы, отчёт придётся переформировать и отправить корректировку.

Что делать при расхождении

Порядок действий такой: сначала перепровести документы месяца строго в хронологическом порядке (сначала межрасчётные — отпуска, больничные, потом «Начисление зарплаты и взносов»). Если не помогло — документ «Перерасчёт страховых взносов» в разделе «Налоги и взносы». Он пересчитывает базу с начала года и доначисляет разницу текущим месяцем. Только после этого переформируйте отчёт.

Тариф МСП или другая льгота: что выбрать, если организация подходит под несколько

Вид тарифа в ЗУП — один на организацию и период. Выпадающий список короткий, но в нём есть позиции, которые легко перепутать. Компания в реестре МСП с производством мебели формально подходит и под обычный тариф МСП, и под тариф для обрабатывающих производств. Ставки разные, и выбор стоит денег.

Чем отличаются варианты

Обычный тариф МСП — 15% к части выплат сверх 1,5 МРОТ. Условие одно: быть в реестре и не относиться к исключённым отраслям.
Тариф для МСП обрабатывающих производств — 7,6% к части сверх 1,5 МРОТ. Условий больше: основной вид деятельности должен входить в утверждённый перечень обрабатывающих производств, а доля доходов от него — составлять не менее 70% за предыдущий год и по итогам отчётных периодов текущего.
Тариф для аккредитованных ИТ-компаний — самостоятельная льгота, с делением по 1,5 МРОТ не связан вообще. Здесь порог не применяется.

Разница на цифрах

Тот же сотрудник с окладом 60 000 руб. Часть в пределах порога (40 639,50 руб.) в обоих случаях облагается по 30% — это 12 191,85 руб. Дальше расходимся:

ставка 15%: 19 360,50 × 15% = 2 904,08 руб., итого 15 095,93 руб.
ставка 7,6%: 19 360,50 × 7,6% = 1 471,40 руб., итого 13 663,25 руб.

Экономия — около 1 433 руб. в месяц на человека. На штате в 30 сотрудников с такими окладами это примерно 516 тысяч рублей за год. Ради такой суммы стоит один раз проверить долю доходов по бухгалтерским данным.

Как изменить в 1С ЗУП льготы по МСП на профильный тариф

Через ту же историю поля «Вид тарифа» в учётной политике организации. Не создавайте вторую организацию и не пытайтесь совмещать два тарифа в одном периоде — программа возьмёт последнюю действующую запись, а расчёт по двум основаниям одновременно типовой алгоритм не поддерживает.

Отдельно про право на льготу: если доля профильных доходов упала ниже 70% по итогам отчётного периода, тариф теряется с начала года, а не с месяца нарушения. Это ключевая разница с исключением из реестра МСП. Пересчёт получится сплошным за весь год, поэтому долю доходов лучше контролировать ежеквартально вместе с бухгалтерией, а не в декабре.

Как не потерять расчёт взносов при переносе базы или запуске ЗУП с середины года

Настройка тарифа переживает обновление релиза без проблем — она хранится в данных, а не в конфигурации. Ломается другое: накопленная база по физлицам. И ломается тихо, без сообщений об ошибках.

Три ситуации, в которых это происходит:

Стартовали в ЗУП не с января. Компания вела расчёт в другой программе, перешла в ЗУП, например, с июля. Порог 1,5 МРОТ считается помесячно и не пострадает, а вот единая предельная база — накопительная. Программа думает, что с начала года ничего не начислялось, и не переключится на пониженную ставку после превышения. Лечится документом «Перенос данных» (раздел «Администрирование») — вносятся суммы выплат и исчисленных взносов по каждому физлицу помесячно с января.
Свёртка или перенос в чистую базу. Тот же эффект плюс риск потерять историю поля «Вид тарифа». После переноса откройте учётную политику и убедитесь, что запись с датой 01.01.2026 на месте, а не затёрлась единственным текущим значением.
Смена юрлица с переводом сотрудников. База по взносам в новой организации начинается с нуля — это нормально и по закону. Ошибка возникает, когда сотрудников заводят новыми элементами справочника физлиц вместо выбора существующих. Тогда в пределах одной организации у человека появляется вторая база.

Проверка после переноса — пять минут

Сформируйте отчёт «Анализ взносов в фонды» за период с января по текущий месяц и сверьте итоговую базу по нескольким сотрудникам с расчётными листками из старой системы. Отдельно прогоните сервис поиска и объединения дублей по справочнику физических лиц — раздел «Администрирование» → «Обслуживание». Дубли ИНН и СНИЛС всплывают именно здесь, а не в момент расчёта.

И последнее: делайте выгрузку базы перед тем, как править историю тарифа или запускать перерасчёт взносов за прошлые месяцы. Откатить неудачный «Перерасчёт страховых взносов» можно только распроведением документов в обратном хронологическом порядке, а это полдня работы на средней базе.

Частые вопросы о настройке пониженного тарифа МСП в 1С:ЗУП

Нужно ли подавать заявление в налоговую на пониженный тариф?

Нет. Право возникает автоматически с момента включения в единый реестр МСП. Никаких уведомлений, заявлений и подтверждающих документов подавать не требуется — ФНС видит статус по своему же реестру.

Как в 1С ЗУП настроить пониженный тариф страховых взносов в 2026 году, если релиз конфигурации старый?

Никак корректно не настроите. Логика деления базы на две части зашита в типовой алгоритм расчёта, а не в справочники — ручная правка МРОТ и предельной базы в устаревшем релизе не заставит программу применять новый порядок. Обновите ЗУП 3.1 до актуального релиза, потом ставьте тариф. Обновление до начала расчёта январской зарплаты экономит день на пересчётах.

Применяется ли порог 1,5 МРОТ пропорционально отработанному времени?

Нет. Порог не делится на дни. Сотрудник отработал полмесяца и получил 25 000 руб. — вся сумма попадает в часть «в пределах 1,5 МРОТ», льготная часть нулевая. Это частая претензия бухгалтеров к программе: кажется, что ЗУП посчитал неверно, а он посчитал правильно.

Распространяется ли тариф МСП на выплаты по договорам ГПХ?

Да, если выплата облагается взносами. Порог 1,5 МРОТ применяется к общей сумме выплат физлицу за месяц по всем основаниям. В ЗУП это работает автоматически при условии, что договор ГПХ оформлен документом «Договор (работы, услуги)», а не разовым начислением с произвольной настройкой.

Тариф устанавливается на организацию целиком или по подразделениям?

На организацию. Вид тарифа — реквизит учётной политики организации, обособленные подразделения его наследуют. Если в базе несколько юрлиц, тариф надо выставить в карточке каждого отдельно — это забывают чаще всего при добавлении новой организации в середине года.

Что будет, если оставить общий тариф 30% и не переходить на льготный?

Программа посчитает больше, чем нужно, и вы переплатите. Вернуть переплату можно — через уточнённый РСВ и заявление на зачёт, но это лишний квартал переписки с инспекцией. Проще потратить пять минут на учётную политику.

Сотрудник уволился и вернулся в том же году — как считается база?

База по взносам считается нарастающим итогом по физлицу, а не по трудовому договору. ЗУП объединяет периоды автоматически, если это одно и то же физическое лицо в справочнике. Проблема возникает, когда человека завели вторым элементом справочника — тогда база обнулится, а порог 1,5 МРОТ применится дважды за месяц. Проверяйте дубли через сервис поиска и объединения элементов.